Traitement des espaces entre le sol et les plaques de placo?

Bonjour,
J'ai enlevé des plinthes dans mon salon car j'envisage de mettre un parquet avec un quart de rond comme finition. Le problème est que derrière les plinthes j'ai découvert que les plaques de placo ne vont pas jusqu'au sol. Souvent elles sont posées sur des morceaux de bois et mêmes sur de l'aggloméré. Y a-t-il une raison pour cela? (Genre aération?) Est-ce que je peux reboucher ces espaces avec l'enduit de rebouchage ou un autre produit sans conséquences?
Avant d'installer un parquet j'aurai besoin de ragréer le sol, dont les bords (à mon sens) devraient au moins être étanches.
Merci pour vos conseils.